Così su due piedi mi verrebbe da dire che la ripresa non è stata fatta con tutti i crismi del caso. La macchina non decide nulla da sola. La macchina esegue quello che gli fai fare tu. Se è tutto ok lo esegue bene, se ci sono problemi i guai escono.
Prima di valutare lavori del genere dove le variabili in gioco sono molte io direi di partire
con qualcosa di più semplice da analizzare. Fresare il solito quadrato 100x100 (ad esempio) e misurarne i lati, verificarne il parallellismo e l'ortogonalità dopo aver, ovviamente, verificato che l'utensile montato sul mandrino giri in asse.
Poi tasca quadrata di stessa misura più un paio di decimi di tolleranza e provi ad infilarci il quadrato tagliato prima (occhio ai vertici) il quale deve entrare sempre anche se lo ruoti di 90/180/270 gradi. Se questa prova passa allora meccanica ed elettronica sono ok.