nelle varie isel 3040 che ho visionato e partecipato a rimettere in moto confermo che ti basta trovare i pin che portano alimentazione ai motori.
A seconda dei motori puoi andare su driver come DM542/DM556 o superiori.
Dal connettore come detto troverai su altri pin i segnali relativi ai limit. Controlla che siano in serie/parallelo e regola di conseguenza.
Puoi andare ad usare tranquillamente un mach3 su queste macchine riviste.
Se vuoi mantenere anche il controller originale (cosa che puoi comunque fare) dovrai lasciare il cablaggio dei limit nello stato attuale e prevedere nella centralina della macchina la possibilità di fare lo switch tra un controller e l'altro. Questa operazione la dovrai fare in manuale però, cioè dovrai spegnere il tutto e manualmente modificare il cablaggio ogni volta che vuoi fare il cambio.
Anni addietro penso che un utente abbia già fatto su questo forum qualcosa di simile su una isel 3040.