Non andare in paranoia. Le macchine CNC hobbistiche sono così. E per sistemarle si imparano un sacco di cose.... Quando la avrai sistemata conoscerai la tua macchina molto meglio si prima

Altra cosa: io ti consiglio di fare dei test con dei percorsi più articolati. E non con movimenti semplici. Questo perché il problema.potrebbe non verificarsi sempre, per esempio potrebbe accadere che dopo 3 minuti di lavoro i motori si sono scaldati e perdi passi, o altri motivi. È per questo che ti consigliato cam bam o altro. Crei un percorso semplice e fai girare la.macchina a vuoto con il mandrino spento. Parti da velocità bassa e accelerazione bassa. Poi ripeti alzando pian piano (impostando direttamente dal cam).
Ci vuole tempo ma è un test molto più preciso. E anche se venisse fuori che non è un problema di parametri ti servirà comunque a testare le capacità della tua macchina.